Résumé : *La dynamique des communautés microbiennes observée expérimentalement

en bioréacteurs est extrêmement rapide, entrainant une divergence rapide des

communautés, alors que les conditions opératoires sont strictement contrôlées.

La modélisation basée sur des équations différentielles de compétition pour des

ressources ne prend pas en compte cette information. Ces observations

expérimentales suggèrent au contraire l'utilisation de modèles stochastiques.

Les modèles neutres en écologie des communautés ont récemment été développés,

intégrant une part de stochasticité dans la dynamique des communautés. Le

postulat de base de cette théorie est que toutes les espèces sont

fonctionnellement équivalentes, et que la diversité observée localement (ou

globalement à plus grande échelle) est la résultante d'un équilibre stochastique

entre l'immigration locale (ou la spéciation à plus grande échelle) et de

l'extinction d'espèces. Bien que ces hypothèses de départ soient biologiquement

sans fondement, elles permettent de construire des modèles globaux qui sont

capables de reproduire des structurations écologiques observées dans la nature.

Des études récentes suggèrent que ces modèles seraient adaptés aux communautés

microbiennes. Le véritable challenge est de départager l'importance relative de

l'hypothèse de neutralité et des facteurs environnementaux dans la dynamique des

communautés microbiennes. Cette question centrale sera objet de ce travail de

thèse, et sera étudiée d'un point de vue théorique et expérimental.

* Lieu* : Laboratoire de Biotechnologie de l'Environnement, INRA Narbonne

http://www.montpellier.inra.fr/narbonne

* Personnes à contacter* :

Jean-Jacques GODON, INRA, LBE, Avenue des Etangs, 11100 Narbonne

godon@supagro.inra.fr Tel : 04 68 42 51 54

Jérôme Hamelin, INRA, LBE, Avenue des Etangs, 11100 Narbonne

hamelin@supagro.inra.fr Tel : 04 68 42 51 56