PhD opportunity

Durrell Institute of Conservation and Ecology (DICE), University of Kent



Applications are invited for this 3-year, funded PhD studentship, which will
start in September 2009 and be co-hosted by DICE
(http://www.kent.ac.uk/anthropology/dice/) at the University of Kent's
Canterbury campus and Ifremer (http://www.ifremer.fr), the French Research
Institute for Exploitation of the Sea, at their centre in Boulogne-sur-Mer.
This important project, supervised by Dr Bob Smith and Professor Stuart
Harrop from DICE and Dr Sandrine Vaz from Ifremer, will be part of ongoing
work to develop marine protected area systems in the Eastern English
Channel.

Project Outline
Many marine ecosystems are under severe anthropogenic pressure.
Consequently, governments are responding by developing marine protected area
(MPA) systems, with the aim of conserving biodiversity and protecting fish
stocks. Since 2004, the CHARM project (Channel Habitat Atlas for Marine
Resource Management) has collected a range of biological, economic, legal
and social data to help inform management of the Eastern English Channel.
This PhD project will build on this and develop approaches to inform ongoing
MPA designation initiatives in the region and elsewhere. In particular, it
will focus on:

1) Setting numerical targets for conserving important species and habitat
types based on biological and legal requirements.

2) Developing techniques for incorporating biodiversity, policy and social
data into a systematic conservation planning assessment for the Eastern
English Channel

3) Modelling the impacts of different MPA network scenarios on biodiversity,
fish stocks and fishing effort.

Application details
The successful candidate will have a good degree in a relevant subject, a
keen interest in marine conservation and interdisciplinary research, and
excellent quantitative analytical skills. Proficiency in French and
experience with using the ArcGIS and Marxan software packages would be an
advantage.

The PhD Studentship covers tuition fees at Home/EU rates and pays an annual
stipend of ?13,000. The student will be co-hosted by DICE and Ifremer and
will spend approximately two thirds of their time in Canterbury and one
third in Boulogne-sur-Mer.

To apply, please send a CV and a covering letter detailing your research
interests, and giving the names of two referees who can be contacted when
short-listing, by 8th June 2009 to Dr Bob Smith (R.J.Smith@kent.ac.uk). We
will hold interviews shortly thereafter. Informal enquiries can also be made
to Dr Bob Smith by email or phone on +44 (0)1227 823455.

This position will focus on the relationship between geographical range and niche and genetic variation, and explore the patterns of inheritance of the niche and genetic attributes of selected species. This student?s primary location will be in the Linder lab at the University of Zurich.

Applications MUST be received no later than Sunday, May 31, 2009.

Interviews to be held fourth week in June. Start date in September,
2009.

For further information about the SPEED project:



http://www.wsl.ch/projects/SPEED



Please contact Peter B. Pearman or the relevant person linked to your
interest. The SPEED project proposal is available to interested
applicants upon request.



To apply, send the following materials, as separate PDF files:

1. PDF of cover letter, addressed to The SPEED Search Committee,
indicating

--position applied for

--your career goals

--your research interests in context of the SPEED project

--a detail of how the previous experience and skills shown in
your CV prepare you specifically for the position for which you are
applying

2. PDF of CV, complete, showing contact information, title of thesis
and dissertation, date, universities, research experience, notable
skills, advanced courses, publication list, posters and talks
presented, awards, service, etc

3. PDF of the abstract of your Masters thesis or Ph.D. dissertation
research

4. PDF of university report of coursework, showing grades and degrees
earned (must be in English)

5+. PDF's of published papers and papers in-press.



Send application as e-mail with attachments, with the following
subject line



SPEED Project (and insert position applied for: evolutionary modeling,
population genetics,or post-doc)



Send a separate e-mail, cover letter (PDF), and other PDF documents
for each position applied for (if more than one) to:



sibylle.hauser@wsl.ch



Don?t forget the deadline!

Résumé : *Le Laboratoire de Biotechnologie de l'Environnement (LBE) de l'INRA

de Narbonne possède une double expertise ; en écologie microbienne d'une part,

et dans la mise en ¦uvre de procédés innovants de l'échelle laboratoire à

l'échelle industrielle d'autre part. Les micro-organismes sont très largement

responsables des performances épuratoires dans les bioréacteurs de dépollution.

Or, on constate que des procédés biologiques impliquant une faible diversité

microbienne sont soumis à des fluctuations de performance. De même, une taille

minimale de réacteur semble requise pour assurer la robustesse d'un procédé.

L'objectif de ce travail est donc de mieux explorer le lien pouvant exister

entre le volume d'un bioréacteur, la diversité microbienne présente, et la

performence de l'écosystème. La comparaison de plusieurs classes de réacteurs

(aérobie/anaérobie, cellules libres/biofilms) sera réalisée au cours de la

thèse, le but étant toujours de tester environ 6 ordres de grandeur de taille en

parallèle. La diversité microbienne sera évaluée à partir d'empreintes

moléculaires.

*Domaines de compétence* : Environnement, Sciences pour l'Ingénieur

*Lieu* : Laboratoire de Biotechnologie de l'Environnement, INRA Narbonne

http://www.montpellier.inra.fr/narbonne

*Personnes à contacter* :

Jean-Jacques GODON, INRA, LBE, Avenue des Etangs, 11100 Narbonne

godon@supagro.inra.fr Tel : 04 68 42 51 54

Jean-Philippe DELGENES, INRA, LBE, Avenue des Etangs, 11100 Narbonne

delgenes@supagro.inra.fr Tel : 04 68 42 51 51

Il est disponible sur le site de l'ED SIBAGHE Montpellier UM2

Les candidats extérieurs à notre ED sont prioritaires sur ce sujet mais doivent avoir d'excellents dossiers.

Merci

Ilhem

*Directeur de thèse *: Ilhem Bentaleb, MC UM2, HDR

*Codirecteur* : Celine Martin, CDD ANR

*Laboratoire d’accueil* : Institut des Sciences de l’Evolution de Montpellier, Equipe paléoenvironnements et paléoclimats

*Discipline/Thématique* : Environnements marins et climats

Ce projet se focalise sur l'effet des changements climatiques sur l’écosystème pélagique de l’Océan Austral en utilisant l’éléphant de mer comme bio-indicateur de son évolution et comme plateforme océanographique pour collecter des données physiques et biologiques de l’environnement marin.

*Description :*

L’Océan Austral abrite une biodiversité remarquable tant par le nombre d’espèces que par leur biomasse. Le dénombrement de ces populations a récemment révélé un déclin de certaines espèces en rapport étroit avec la diminution de la glace de mer en Antarctique, soulignant ainsi l’importance de cet habitat pendant la période hivernale. Cependant, les mécanismes sous-jacents, essentiellement trophiques, restent encore à élucider. Parmi les prédateurs marins austraux, l’éléphant de mer est un modèle particulièrement pertinent pour étudier les conséquences écosystémiques des variations de l’environnement marin, car : 1) leur population à Kerguelen a chuté de moitié dans les années 70-80 pour se stabiliser ensuite, 2) ils se reproduisent sur les îles subantarctiques mais parcourent en hiver de longues distances pour atteindre des sites d’alimentation dont certains sont antarctiques, et 3) d’un point de vue pratique, ils sont relativement faciles d’accès car ils viennent à terre pour se reproduire. Leur suivi satellitaire à Kerguelen a récemment révélé deux principales zones d’alimentation: la zone périantarctique de banquise et la zone polaire frontale, plus au nord. Du succès de ces voyages alimentaires dépend l’accumulation de réserves énergétiques par les femelles qui jeûnent totalement pendant la reproduction. L’importance de ces réserves affecte la masse au sevrage des nouveau-nés et donc leur probabilité de survie. Tous ces paramètres, et de façon ultime les populations d’éléphants de mer, sont donc influencés par les variations environnementales, incluant entre autres, la disponibilité alimentaire hivernale.

*Objectifs* : Entre 1980 et 1990 la population d'éléphants de mer de Kerguelen a baissé de façon dramatique. Une légère amélioration a permis de stabiliser cette population jusqu'en 2001 mais depuis on enregistre à nouveau une détérioration. Les changements climatiques (augmentation de la température, diminution de la glace de mer) modifient-t-il les écosystèmes et par conséquent les ressources alimentaires de ces populations? Nous voulons identifier les causes de la baisse de la biodiversité afin de mieux penser les solutions à envisager pour leur survie. Nous proposons de mieux comprendre les influences 1) des changements climatiques sur l’Océan Austral donc sur la productivité primaire et la chaîne trophique et 2) des stratégies alimentaires sur le succès reproducteur des éléphants de mer (coll. Yves Cherel, C. Guinet) La principale méthode utilisée sera celle des isotopes stables du carbone et de l’azote de la matière organique de la dentine des dents d’éléphants de mer collectées au cours des 60 dernières années.

*Plan de travail :* Dans le but de comprendre pourquoi la population d’éléphants de mer de Kerguelen a baissé de manière importante, et à travers elle quels sont les changements ayant affectés l’écosystème pélagique de l’Océan Austral pendant les 50 dernières années, nous utiliserons la signature isotopique et les éléments traces de tissus à croissance continue (dents) enregistrant et ayant enregistrés l’écologie alimentaire des animaux (« archival tags »).

- Sur des animaux d’aujourd’hui, l’approche sera testée et validée, en particulier pour évaluer le niveau de fidélité des éléphants de mer à une stratégie alimentaire donnée (exploitation des mêmes zones d’alimentation ou non par le même individu d’année en année).

- Ces animaux serviront alors de contrôles pour mieux interpréter les résultats obtenus sur des éléphants de mer conservés dans des musées, ce qui nous permettra de remonter le temps afin d’établir si oui ou non des changements de leurs stratégies alimentaires ont eu lieu pendant les années 70-80 et permettent d’expliquer la baisse de population observée pendant cette période.

1- Photos et Moulage de toutes les archives

2- Ageage des dents : lecture sur lames minces des incréments de croissance des dents (Adobe photoshop ou autre logiciel)

3- Prélèvement au Microdrill de la poudre de dentine pour des isotopes stables du carbone et de l’azote qui nous renseignent respectivement sur les zones d’alimentation et le niveau trophique des prédateurs marins.

4- Interprétation des résultats en terme de migrations, ressources alimentaires, vulnérabilité et changements climatiques.

Missions de terrain possible mais non indispensable à Kerguelen.

*Financement : C*e projet s'inscrit dans le cadre du programme ANR-VMC 2007 IPSOS-SEAL (responsable: C. Guinet) financé par l'ANR pour les années 2008-2011 et projet finacé sur le WP3 resp. I. Bentaleb.

-- 

Ilhem Bentaleb

-------------------------------------------------

Institut des Sciences de l’Evolution - Montpellier (I.S.E.-M.)

Unité Mixte de Recherche UMII - CNRS (UMR 5554)

Université de Montpellier II - CC 064

Equipe Paléoenvironnements et Paléoclimats

34095 MONTPELLIER Cedex 05

Téléphone : +33 (0)4 67 14 49 28

Télécopie : +33 (0)4 67 14 40 44

Institut des Sciences de l'Evolution :

http://www.isem.cnrs.fr/